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突破免疫治療精準盲區 FFPE檢體測TMB立大功

來源:網友提交 2019-07-21 編輯:『忙著老去』
 

免疫治療與標靶新藥百花齊放,許多癌癥患者略過自費的基因診斷步驟,卻又苦于成效不彰;其實只要從FFPE腫瘤檢體取得完整癌細胞基因信息,再難治的癌癥,都有機會找對藥治療。

突破免疫治療精準盲區 FFPE檢體測TMB立大功

奇美醫院病理中心部長李健逢與臺灣基因檢測公司行動基因合作,大規模的利用「廣泛型基因檢測」以次世代定序(NGS)分析來自各癌別的407件FFPE腫瘤檢體,獲得多種抗藥性以及影響免疫療法的基因突變信息,創建起臺灣首見的大型NGS本土數據庫,可造福需新藥試驗的患者。李健逢醫師指出,這證實了FFPE腫瘤檢體能作為醫院常規基因檢測,且透過精密的基因分析,有助患者聰明分配整體療程的醫藥費。

FFPE檢體具診斷優勢 美國NCCN指南推至第一線

李健逢醫師說明,FFPE將取出的腫瘤組織樣本,經福馬林固定制成石蠟包埋檢體,讓病理醫師削片染色診斷病情,是常規病理報告最常用的檢體,并有利保存進行研究。

針對FFPE和血液檢體的差異,他解釋,以FFPE檢體進行分析,更能直接從病變組織上找出問題來源,抽血檢測血中的循環腫瘤DNA(ctDNA),則成為無法取得組織切片者的選擇,但仍有30%患者其ctDNA未在被癌細胞發布到血液時被測得;美國NCCN肺癌腫瘤治療指引也建議,第一線治療以檢測FFPE檢體為主,不建議以血液切片取代。

癌癥突變特性一覽無遺  FFPETMB更助免疫治療

 

FFPE在檢測前所需的優化作業有一定難度,而醫院多缺乏相關資源,因此對FFPE檢體是否能符合多基因檢測需求仍存疑。對此,李健逢醫師與臺灣基因檢測公司行動基因合作,透過其具95%成功率的檢體優化技術,成功提升FFPE檢體中腫瘤細胞的比例,并利用「廣泛型基因檢測」以NGS分析407件FFPE檢體,發現臺灣各類癌癥患者除帶有多種抗藥性突變,更有與免疫治療相關的常見突變和特殊突變,證實優化后的FFPE檢體可成為癌癥多基因檢測的首選。

針對患者是否適合免疫治療,李健逢醫師指出,目前強調腫瘤的PD-L1/PD-1或CTLA-4表現量高,是為確認腫瘤有借由該機轉躲避免疫細胞辨認的工具,并以單株抗體抑制PD-L1/PD-1等抗原,阻斷腫瘤細胞逃脫免疫辨識的機會,但單獨PD-L1/PD-1并非可靠因子,「有些并未表現出PD-L1/PD-1的患者,治療仍有效;有些表現出來的患者,治療卻無效。」形成免疫治療在精準度上的盲區。

「要能從免疫治療獲益,關鍵在于阻斷腫瘤細胞逃脫免疫辨識的機會后,免疫細胞能否認出癌細胞,進而將之消滅。」他強調,若癌細胞突變產生可被免疫系統辨識的抗原(neoantigen)越多,被免疫細胞認出的機率越高。近來研究顯示,代表腫瘤有多少抗原突變的「腫瘤突變負荷量」(tumor mutational burden, TMB)成為免疫治療的關鍵指針,將PD-L1/PD-1和TMB共同評估的精準度更佳,若兩指數都很高,免疫治療可更有成效。

特定癌別TMB在臺灣與國外大不同 誰適合免疫治療更需檢測

本次研究發現,與紀念斯隆—凱特琳癌癥中心(MSKCC)、美國癌癥基因體圖譜計劃TCGA等數據庫比較,臺灣肺癌的TMB平均較低,另外臺灣食道癌以鱗狀上皮細胞癌為主,與美國較常見腺癌不同,其TMB也較低。其他種類癌癥也存在細微但無法忽略的差異。李健逢醫師說,這可能可以解釋為何臺灣和國外相同癌癥的免疫治療效果不同。

在407個檢體中,也發現家族性遺傳乳癌病患,可能會將致癌基因遺傳給小孩,因此可先進行遺傳篩檢提早預防。另外,也有神經內分泌瘤復發的患者,發現其TMB高,進行免疫治療后,無法切除的腫瘤都消失了。

李健逢醫師提到,這次透過「廣泛型基因分析」的407個案例分布各類型腫瘤,未來須針對特定癌癥含括更多樣本,并公開給各藥廠,為臺灣患者爭取新藥試驗的機會。

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